MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 29191 plasmid pZZ6.02

Total Repeats: 248

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018147	TTCAAA	2	12	234	245	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397677567
2	NC_018147	ATT	2	6	246	251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677567
3	NC_018147	GCTG	2	8	263	270	0 %	25 %	50 %	25 %	397677567
4	NC_018147	CTG	2	6	296	301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677567
5	NC_018147	GAT	2	6	377	382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677567
6	NC_018147	AGC	2	6	405	410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677567
7	NC_018147	CTT	2	6	413	418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677567
8	NC_018147	ATC	2	6	426	431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677567
9	NC_018147	ATA	2	6	432	437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677567
10	NC_018147	TAA	2	6	468	473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677567
11	NC_018147	TCC	2	6	498	503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677567
12	NC_018147	ATTT	2	8	510	517	25 %	75 %	0 %	0 %	397677567
13	NC_018147	T	6	6	575	580	0 %	100 %	0 %	0 %	397677568
14	NC_018147	TGGC	2	8	603	610	0 %	25 %	50 %	25 %	397677568
15	NC_018147	CTT	2	6	679	684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677568
16	NC_018147	TATTCA	2	12	745	756	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397677568
17	NC_018147	GT	3	6	778	783	0 %	50 %	50 %	0 %	397677568
18	NC_018147	TGA	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677569
19	NC_018147	GATATT	2	12	1847	1858	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397677569
20	NC_018147	AG	3	6	2022	2027	50 %	0 %	50 %	0 %	397677569
21	NC_018147	ATA	2	6	2049	2054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677569
22	NC_018147	TCA	2	6	2101	2106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677569
23	NC_018147	TTG	2	6	2117	2122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677569
24	NC_018147	CAGCGA	2	12	2164	2175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677569
25	NC_018147	TTATT	2	10	2187	2196	20 %	80 %	0 %	0 %	397677569
26	NC_018147	CTA	2	6	2274	2279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677569
27	NC_018147	CTG	2	6	2318	2323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677569
28	NC_018147	GCT	2	6	2338	2343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677569
29	NC_018147	GGC	2	6	3122	3127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397677570
30	NC_018147	GGTGCC	2	12	3128	3139	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	397677570
31	NC_018147	ATTG	2	8	3224	3231	25 %	50 %	25 %	0 %	397677570
32	NC_018147	GTG	2	6	3239	3244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677570
33	NC_018147	AGCT	2	8	3286	3293	25 %	25 %	25 %	25 %	397677570
34	NC_018147	T	7	7	3420	3426	0 %	100 %	0 %	0 %	397677571
35	NC_018147	TAA	2	6	3492	3497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677571
36	NC_018147	T	6	6	3511	3516	0 %	100 %	0 %	0 %	397677571
37	NC_018147	GAA	2	6	3533	3538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677571
38	NC_018147	TCT	2	6	3557	3562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677571
39	NC_018147	CAT	2	6	3563	3568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677571
40	NC_018147	TGT	2	6	3576	3581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677571
41	NC_018147	TCT	3	9	3604	3612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677571
42	NC_018147	AAG	2	6	3620	3625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677571
43	NC_018147	TAC	2	6	3633	3638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677571
44	NC_018147	TGT	2	6	3742	3747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677571
45	NC_018147	ATTTA	2	10	3750	3759	40 %	60 %	0 %	0 %	397677571
46	NC_018147	TGC	2	6	3804	3809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677571
47	NC_018147	AGA	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677572
48	NC_018147	TCG	2	6	4482	4487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677572
49	NC_018147	TAGA	2	8	4541	4548	50 %	25 %	25 %	0 %	397677572
50	NC_018147	ATC	2	6	4561	4566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677572
51	NC_018147	CGA	2	6	4601	4606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677572
52	NC_018147	T	6	6	4661	4666	0 %	100 %	0 %	0 %	397677573
53	NC_018147	CTGTT	2	10	4691	4700	0 %	60 %	20 %	20 %	397677573
54	NC_018147	TCT	2	6	4754	4759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677573
55	NC_018147	GA	3	6	4765	4770	50 %	0 %	50 %	0 %	397677573
56	NC_018147	CTGA	2	8	4805	4812	25 %	25 %	25 %	25 %	397677574
57	NC_018147	ATT	2	6	4826	4831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677574
58	NC_018147	GAA	3	9	4838	4846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677574
59	NC_018147	AAG	2	6	4913	4918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677574
60	NC_018147	ACC	2	6	5139	5144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397677575
61	NC_018147	TCT	2	6	5145	5150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677575
62	NC_018147	ATC	2	6	5156	5161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677575
63	NC_018147	CGT	2	6	5173	5178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677575
64	NC_018147	TTC	2	6	5189	5194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677575
65	NC_018147	TCT	2	6	5211	5216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677575
66	NC_018147	TGC	2	6	5399	5404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677575
67	NC_018147	GAA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677575
68	NC_018147	A	7	7	5424	5430	100 %	0 %	0 %	0 %	397677575
69	NC_018147	ACC	2	6	5455	5460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397677575
70	NC_018147	GCC	2	6	5484	5489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677575
71	NC_018147	CGA	2	6	5546	5551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677575
72	NC_018147	CCGT	2	8	5827	5834	0 %	25 %	25 %	50 %	397677575
73	NC_018147	TGG	2	6	5857	5862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677575
74	NC_018147	GTC	2	6	5934	5939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677575
75	NC_018147	TGC	2	6	5944	5949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677575
76	NC_018147	TCAA	2	8	5991	5998	50 %	25 %	0 %	25 %	397677575
77	NC_018147	AGAC	2	8	6004	6011	50 %	0 %	25 %	25 %	397677575
78	NC_018147	CGC	2	6	6024	6029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677575
79	NC_018147	GGA	2	6	6115	6120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397677575
80	NC_018147	TGA	2	6	6134	6139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677575
81	NC_018147	AGAC	2	8	6157	6164	50 %	0 %	25 %	25 %	397677575
82	NC_018147	CCT	2	6	6198	6203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677575
83	NC_018147	GA	3	6	6215	6220	50 %	0 %	50 %	0 %	397677575
84	NC_018147	CGAG	2	8	6284	6291	25 %	0 %	50 %	25 %	397677575
85	NC_018147	AAC	2	6	6295	6300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677575
86	NC_018147	AAG	2	6	6307	6312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677575
87	NC_018147	AAG	2	6	6321	6326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677575
88	NC_018147	AGG	2	6	6376	6381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397677575
89	NC_018147	TTAT	2	8	6452	6459	25 %	75 %	0 %	0 %	397677575
90	NC_018147	CGA	2	6	6467	6472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677575
91	NC_018147	AGA	3	9	6491	6499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677575
92	NC_018147	ACTGC	2	10	6505	6514	20 %	20 %	20 %	40 %	397677575
93	NC_018147	GCAG	2	8	6525	6532	25 %	0 %	50 %	25 %	397677575
94	NC_018147	GTT	2	6	6540	6545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677575
95	NC_018147	ACCTGA	2	12	6557	6568	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397677575
96	NC_018147	A	7	7	6578	6584	100 %	0 %	0 %	0 %	397677575
97	NC_018147	ATG	2	6	6660	6665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677575
98	NC_018147	TGA	2	6	7174	7179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677576
99	NC_018147	TAA	2	6	7217	7222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677576
100	NC_018147	T	6	6	7232	7237	0 %	100 %	0 %	0 %	397677576
101	NC_018147	TTC	2	6	7250	7255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677576
102	NC_018147	TAT	2	6	7367	7372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677576
103	NC_018147	ATT	2	6	7399	7404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677576
104	NC_018147	AT	3	6	7410	7415	50 %	50 %	0 %	0 %	397677576
105	NC_018147	AAG	2	6	7428	7433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677576
106	NC_018147	GAT	2	6	7443	7448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677576
107	NC_018147	GAA	2	6	7458	7463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677576
108	NC_018147	TA	3	6	7464	7469	50 %	50 %	0 %	0 %	397677576
109	NC_018147	TGA	2	6	7514	7519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677576
110	NC_018147	T	6	6	7522	7527	0 %	100 %	0 %	0 %	397677576
111	NC_018147	TCT	2	6	7545	7550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677576
112	NC_018147	T	8	8	7577	7584	0 %	100 %	0 %	0 %	397677576
113	NC_018147	AAG	3	9	7591	7599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677576
114	NC_018147	A	7	7	7631	7637	100 %	0 %	0 %	0 %	397677576
115	NC_018147	T	7	7	7660	7666	0 %	100 %	0 %	0 %	397677576
116	NC_018147	GAT	2	6	7704	7709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677576
117	NC_018147	GCT	2	6	7740	7745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677576
118	NC_018147	GCT	2	6	7782	7787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677576
119	NC_018147	TAG	2	6	7864	7869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677576
120	NC_018147	ATT	2	6	7877	7882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677576
121	NC_018147	AAT	2	6	7892	7897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677576
122	NC_018147	A	8	8	7944	7951	100 %	0 %	0 %	0 %	397677576
123	NC_018147	A	6	6	7953	7958	100 %	0 %	0 %	0 %	397677576
124	NC_018147	T	6	6	7994	7999	0 %	100 %	0 %	0 %	397677576
125	NC_018147	T	6	6	8092	8097	0 %	100 %	0 %	0 %	397677576
126	NC_018147	TCT	2	6	8180	8185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677576
127	NC_018147	TAC	2	6	8195	8200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677576
128	NC_018147	TCA	2	6	8262	8267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677576
129	NC_018147	CTG	2	6	8278	8283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677576
130	NC_018147	GTT	2	6	8307	8312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677576
131	NC_018147	ACA	2	6	8315	8320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677576
132	NC_018147	CGT	2	6	8400	8405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677576
133	NC_018147	ATT	3	9	8409	8417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677576
134	NC_018147	TGC	2	6	8447	8452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677576
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138	NC_018147	AGA	2	6	8780	8785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677576
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142	NC_018147	T	6	6	8891	8896	0 %	100 %	0 %	0 %	397677576
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247	NC_018147	TCT	3	9	14588	14596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677585
248	NC_018147	TGC	2	6	14610	14615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677585

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.